MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans D11S-1 chromosome

Total Repeats: 6022

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013416	CTTT	2	8	531160	531167	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1502	NC_013416	T	6	6	531236	531241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_013416	T	6	6	531244	531249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_013416	AGA	2	6	531268	531273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_013416	CGAA	2	8	531279	531286	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1506	NC_013416	CAT	2	6	531292	531297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_013416	TGT	2	6	531342	531347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_013416	T	7	7	531550	531556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_013416	T	6	6	531594	531599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_013416	C	6	6	531617	531622	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1511	NC_013416	A	6	6	531680	531685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_013416	TCA	2	6	531738	531743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_013416	TA	3	6	531815	531820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_013416	ACTT	2	8	532049	532056	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1515	NC_013416	TAT	2	6	532087	532092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_013416	TTG	2	6	532134	532139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_013416	TGA	2	6	532233	532238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_013416	ATTC	2	8	532249	532256	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1519	NC_013416	G	6	6	532843	532848	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_013416	CAT	2	6	532862	532867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_013416	GGA	2	6	532873	532878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_013416	CGT	2	6	532907	532912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_013416	AGG	2	6	533647	533652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_013416	ATTTT	2	10	533670	533679	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_013416	TAC	2	6	533723	533728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_013416	GAAC	2	8	533769	533776	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1527	NC_013416	CAA	2	6	533810	533815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_013416	T	6	6	533825	533830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_013416	ATG	2	6	533832	533837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_013416	ACA	2	6	533839	533844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_013416	CTTA	2	8	533937	533944	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1532	NC_013416	TGA	2	6	533965	533970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_013416	TTCG	2	8	534036	534043	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1534	NC_013416	TGT	2	6	535453	535458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_013416	CCG	2	6	535485	535490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1536	NC_013416	A	6	6	535492	535497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_013416	A	6	6	535544	535549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_013416	AGTT	2	8	535596	535603	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_013416	T	6	6	535602	535607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_013416	CTC	2	6	537056	537061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1541	NC_013416	TTA	2	6	537069	537074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_013416	GTT	2	6	537078	537083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_013416	AAATT	2	10	537114	537123	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_013416	ATTT	2	8	537157	537164	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_013416	T	7	7	537181	537187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_013416	TAT	2	6	537260	537265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_013416	CTC	2	6	537767	537772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1548	NC_013416	T	6	6	537812	537817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_013416	A	6	6	538150	538155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_013416	TCGCAA	2	12	538168	538179	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_013416	TGAA	2	8	538208	538215	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_013416	ATAAA	2	10	538236	538245	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_013416	TCC	2	6	539903	539908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1554	NC_013416	ATCAA	2	10	539934	539943	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1555	NC_013416	T	6	6	539948	539953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_013416	TAA	3	9	540935	540943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_013416	GAAA	2	8	540971	540978	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_013416	TAA	2	6	541193	541198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_013416	C	6	6	541240	541245	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1560	NC_013416	AAGT	2	8	542035	542042	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_013416	TA	3	6	542271	542276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_013416	T	7	7	542876	542882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_013416	GAT	2	6	547157	547162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_013416	A	6	6	547181	547186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_013416	A	6	6	547388	547393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_013416	T	6	6	547412	547417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_013416	ATC	2	6	547424	547429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_013416	T	6	6	548325	548330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_013416	A	6	6	548348	548353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_013416	TAA	2	6	548400	548405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_013416	TTTG	2	8	549170	549177	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_013416	CGG	2	6	549626	549631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_013416	TCG	2	6	549642	549647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_013416	CGG	2	6	549685	549690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_013416	T	6	6	551608	551613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_013416	AGAAA	2	10	557584	557593	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_013416	TCT	2	6	557617	557622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_013416	AAT	2	6	558732	558737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_013416	TAA	2	6	558806	558811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_013416	TAA	2	6	558837	558842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_013416	TTG	2	6	560002	560007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_013416	TG	3	6	560006	560011	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_013416	A	6	6	560075	560080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_013416	GAA	2	6	560101	560106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_013416	TAT	2	6	562696	562701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_013416	TTG	2	6	562756	562761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_013416	TA	3	6	562775	562780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_013416	TAA	2	6	562810	562815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_013416	A	7	7	562855	562861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1591	NC_013416	GGT	2	6	562936	562941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_013416	CAC	2	6	562959	562964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1593	NC_013416	TCC	2	6	562968	562973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1594	NC_013416	CAG	2	6	563029	563034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_013416	GAG	2	6	563035	563040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1597	NC_013416	ATT	2	6	563853	563858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_013416	T	6	6	563860	563865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_013416	GAT	2	6	563873	563878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1601	NC_013416	AGT	2	6	572013	572018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_013416	TTA	2	6	572050	572055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_013416	TAT	2	6	572090	572095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_013416	AAT	2	6	572147	572152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_013416	TTA	2	6	572201	572206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_013416	TCC	2	6	573578	573583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1607	NC_013416	AGAT	2	8	573588	573595	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_013416	CCAC	2	8	573636	573643	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1609	NC_013416	AGA	2	6	573649	573654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_013416	CTT	2	6	573679	573684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_013416	AG	3	6	573720	573725	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_013416	CCG	2	6	573727	573732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1613	NC_013416	AAT	2	6	573781	573786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_013416	TTAA	2	8	573976	573983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_013416	GTA	2	6	575335	575340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_013416	CAA	2	6	575366	575371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_013416	T	6	6	575384	575389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_013416	T	6	6	575395	575400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_013416	TTTC	2	8	576390	576397	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1620	NC_013416	TAA	2	6	577581	577586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_013416	A	6	6	577585	577590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_013416	ATA	2	6	577596	577601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_013416	AAAG	2	8	577650	577657	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_013416	CTC	2	6	580241	580246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1625	NC_013416	GTTT	2	8	580256	580263	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_013416	ATTCG	2	10	580298	580307	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1627	NC_013416	CAAC	2	8	580320	580327	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1628	NC_013416	AC	3	6	583048	583053	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1629	NC_013416	A	6	6	583067	583072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_013416	A	6	6	583111	583116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_013416	TAC	2	6	583171	583176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_013416	TA	3	6	583647	583652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_013416	A	9	9	583668	583676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_013416	A	6	6	584605	584610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_013416	A	7	7	584615	584621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_013416	TTG	2	6	584633	584638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_013416	A	6	6	585718	585723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1639	NC_013416	A	6	6	585752	585757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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